Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja6Q6S5G4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja6Q6S5G4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms