Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bnip1Q6QD59 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms