Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudcd1Q6PIP5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudcd1Q6PIP5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms