Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GmipQ6PGG2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GmipQ6PGG2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms