Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim45Q6PFY8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms