Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFC5

Lrit2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit2Q6PFC5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrit2Q6PFC5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrit2Q6PFC5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms