Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rundc3bQ6PDC0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rundc3bQ6PDC0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms