Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trak1Q6PD31 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trak1Q6PD31 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms