Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q6PD19 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q6PD19 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q6PD19 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q6PD19 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q6PD19 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q6PD19 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q6PD19 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6PD19 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms