Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC061212Q6P8K3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms