Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tsen2Q6P7W5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tsen2Q6P7W5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms