Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Polr2mQ6P6I6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Polr2mQ6P6I6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms