Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms