Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Szrd1Q6NXN1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms