Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rprd2Q6NXI6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rprd2Q6NXI6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms