Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SphkapQ6NSW3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms