Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mvb12bQ6KAU4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mvb12bQ6KAU4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms