Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CltbQ6IRU5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms