Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Krt40Q6IFX3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt40Q6IFX3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt40Q6IFX3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt40Q6IFX3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Krt40Q6IFX3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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