Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap5lQ6GQX2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap5lQ6GQX2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms