Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Carmil1Q6EDY6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Carmil1Q6EDY6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms