Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp7Q6A4J8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp7Q6A4J8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp7Q6A4J8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp7Q6A4J8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp7Q6A4J8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp7Q6A4J8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp7Q6A4J8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp7Q6A4J8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp7Q6A4J8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp7Q6A4J8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp7Q6A4J8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Usp7Q6A4J8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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