Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rftn1Q6A0D4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn1Q6A0D4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms