Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sv2cQ69ZS6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sv2cQ69ZS6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms