Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cntn4Q69Z26 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn4Q69Z26 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms