Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sptbn2Q68FG2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms