Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9aQ68FE2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg9aQ68FE2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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