Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CltcQ68FD5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CltcQ68FD5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms