Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms