Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrp9bQ66X22 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrp9bQ66X22 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms