Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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PtprcapQ64697 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprcapQ64697 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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