Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top2bQ64511 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms