Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Irf4Q64287 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms