Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pan3Q640Q5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pan3Q640Q5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms