Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itga3Q62470 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms