Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sp4Q62445 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sp4Q62445 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms