Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms