Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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