Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epha6Q62413 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms