Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf6Q62311 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf6Q62311 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms