Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SypQ62277 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SypQ62277 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SypQ62277 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SypQ62277 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SypQ62277 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SypQ62277 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms