Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrmsQ62270 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrmsQ62270 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms