Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sprr1bQ62267 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms