Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ttf1Q62187 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttf1Q62187 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ttf1Q62187 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttf1Q62187 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttf1Q62187 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttf1Q62187 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ttf1Q62187 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttf1Q62187 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttf1Q62187 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttf1Q62187 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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