Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3bQ62177 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms