Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Itga7Q61738 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Itga7Q61738 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms