Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gli3Q61602 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms