Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1aQ61495 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1aQ61495 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms