Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsx2Q61412 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms