Protein–RNA interactions for Protein: Q61234

Snta1, Alpha-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snta1Q61234 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snta1Q61234 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snta1Q61234 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms